在很久很久以前，太一大陆发生了惊天的大决战。
　　 九只尾兽同时出场，想借助月华之力重新合并，成为力量巨大的十尾。
　　 为了阻止灾难的发生，各国的忍者纷纷出动……我们的主人翁也正是这场战争中的一员。
　　 由于战场上爆发的能量太过庞大，导致时间与空间错乱。我们的主角带着残破的记忆被卷入了时空漩涡……
　　 对于主人翁来说，记忆既是残破的，又是痛苦的。
　　 他已经忘记了当时参战双方谁对谁错，也忘记了都有哪些人曾经和他一起战斗。但他还记得，那些人都是他的朋友，爱人，老师，亲人……而这些人现在都已经离他而去了。
　　 他要重新回到战场，回到他们身边，但这次他要改变这一结局，要让那些对他来说很重要的人不再离去，要让那些珍贵的回忆一直陪在他的身边。

　　 引子：
　　 相传每个火影都会从前代火影口中得知一个秘密，为了确保这个秘密不被外人知道，所以这个秘密口口相传。它说：有一天，这个世界会因为一个人的到来而改变，六道仙人的伟大的成就会被重现，封印十尾，和平永驻。
　　 现在这个秘密传到了三代火影，他命令暗部要偷偷的关注村中的外来人。这天，主角在忍者演习场被一个暗部发现了……

　　 苏醒：
　　 或许我还能记得，那是在很久很久以前的——未来。
　　 九尾向所有人展现了它的实力，那是从没人见过的力量。而我，当时在场。
　　 绝对的力量撕裂了一切，空间和时间都变成破碎的镜子，当镜子再次拼起来的时候，我看到的不是战场，而是我熟悉又陌生的木叶村。
　　 我知道我是谁，但忘记了还有谁——那些对我来说，最需要珍惜的人……
　　 如果我能回到那一瞬间，我就会找到我的记忆，而他们，也会还在我的身边……
　　 我发誓，绝不让他们再次离去!